Program Studi Magister Manajemen Pendidikan Islam memiliki durasi studi antara 1,5 hingga 2 tahun. Selama menjalankan studi, mahasiswa jenjang magister akan mengikuti serangkaian mata kuliah, seminar, penelitian dan pengabdian bagi masyarakat yang dibimbing oleh dosen-dosen handal dan berkualitas. Program studi ini menawarkan pendalaman berbagai ilmu dan penelitian di bidang manajemen Pendidikan Islam yang lebih mendalam guna mempersiapkan individu mampu menjadi ahli di bidangnya.
Program Studi Magister Manajemen Pendidikan Islam (S2 MPI) telah menerapkan kurikulum berbasis outcome based education (OBE) untuk memenuhi link and match lulusannya dengan kebutuhan dan kesesuaian dunia kerja. Kurikulum OBE yang dirancang disesuaikan pada Kerangka Kualifikasi Nasional Indonesia (KKNI) dan mendukung visi keilmuan FAI-UMSIDA yang bersumber pada Al-Qur’an dan Al- Hadist serta ketentuan yang telah dirumuskan sebagai core value UMSIDA (Uswah, Mandiri, Sinergi, Integritas, Dinamis. Prodi S2 MPI berkontribusi meningkatkan kesejahteraan masyarakat dalam bidang manajemen pendidikan Islam secara professional sesuai perkembangan IPTEKS berdasarkan nilai-nilai Islam yang berwawasan masa depan dan visi keilmuan.
Prodi S2 MPI memiliki kekhasan program studi pada bidang manajemen pendidikan berbasis nilai- nilai Islam, yaitu: uswah, mandiri, sinergis, integritas, dinamis dan amanah sebagai core values UMSIDA. Tata nilai Islam yang dirumuskan sebagai core values UMSIDA, yakni Uswah dapat menjadi contoh yang baik bagi masyarakat, Mandiri secara etis dan organisatoris serta otonom, Sinergi bekerjasama dengan berbagai pihak dalam kebaikan dan ketaqwaan, Integritas diwujudkan dalam kejujuran dan tanggungjawab pada setiap perbuatan, Dinamis: selalu bergerak maju, berkembang, dan terus meningkat, dan Amanah: terpercaya sehingga mendapat pengakuan dan dukungan dari berbagai pihak.
Pelaksanaan penilaian pembelajaran, minimal dua kali dalam satu semester (Ujian Tengah Semester dan Ujian Akhir Semester), dengan menggunakan teknik penilaian yang beragam (termasuk portofolio dan memanfaatkan TIK) dan dilengkapi dengan perangkat yang lengkap: (a) kisi-kisi, (b) alat penilaian, (c) rubrik penilaian, dan (d) sistem penskoran. Penilaian merupakan tahapan yang dilakukan dari beberapa proses mulai dari mengidentifikasi, mengumpulkan dan mempersiapkan data beserta bukti-buktinya untuk mengevaluasi proses dan hasil belajar mahasiswa Prodi S2 MPI dalam rangka pemenuhan Capaian Pembelajaran Lulusan.
Lama studi rata-rata 18-24 bulan, dengan beban 57 SKS.
Prodi S2 MPI telah memiliki dokumen kurikulum yang disusun dan dikembangkan secara a) lengkap, b) koheren, c) mutakhir, d) mengembangkan pembelajaran mandiri dan e) menunjukkan penciri khas Prodi.